MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii CbuG_Q212 chromosome

Total Repeats: 44092

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011527	TTTCT	2	10	53	62	0 %	80 %	0 %	20 %	212211669
2	NC_011527	CCG	2	6	197	202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211670
3	NC_011527	CAA	2	6	203	208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211670
4	NC_011527	CAAA	2	8	247	254	75 %	0 %	0 %	25 %	212211670
5	NC_011527	TAC	2	6	261	266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211670
6	NC_011527	TGGAT	2	10	291	300	20 %	40 %	40 %	0 %	212211670
7	NC_011527	CCT	2	6	356	361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212211670
8	NC_011527	CCAA	2	8	401	408	50 %	0 %	0 %	50 %	212211670
9	NC_011527	AGC	2	6	436	441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211670
10	NC_011527	TCG	2	6	513	518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211670
11	NC_011527	GCC	3	9	545	553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211670
12	NC_011527	TTTA	2	8	596	603	25 %	75 %	0 %	0 %	212211670
13	NC_011527	TGG	2	6	604	609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211670
14	NC_011527	A	6	6	677	682	100 %	0 %	0 %	0 %	212211670
15	NC_011527	TTG	2	6	708	713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211670
16	NC_011527	GTT	2	6	784	789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211670
17	NC_011527	T	6	6	806	811	0 %	100 %	0 %	0 %	212211670
18	NC_011527	GATC	2	8	821	828	25 %	25 %	25 %	25 %	212211670
19	NC_011527	TTC	2	6	839	844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211670
20	NC_011527	AGA	2	6	925	930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211670
21	NC_011527	CTT	2	6	1057	1062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211670
22	NC_011527	TCAA	2	8	1144	1151	50 %	25 %	0 %	25 %	212211670
23	NC_011527	CG	3	6	1300	1305	0 %	0 %	50 %	50 %	212211670
24	NC_011527	ATGGCC	2	12	1316	1327	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	212211670
25	NC_011527	TTGC	2	8	1430	1437	0 %	50 %	25 %	25 %	212211670
26	NC_011527	CGT	2	6	1440	1445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211670
27	NC_011527	AGA	2	6	1456	1461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211670
28	NC_011527	G	6	6	1628	1633	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011527	AAATT	2	10	1642	1651	60 %	40 %	0 %	0 %	212211671
30	NC_011527	ATT	2	6	1665	1670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211671
31	NC_011527	CT	3	6	1741	1746	0 %	50 %	0 %	50 %	212211671
32	NC_011527	TCT	2	6	1834	1839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211671
33	NC_011527	A	6	6	1925	1930	100 %	0 %	0 %	0 %	212211671
34	NC_011527	CCG	2	6	1991	1996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211671
35	NC_011527	TAT	2	6	2098	2103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211671
36	NC_011527	CAAA	2	8	2194	2201	75 %	0 %	0 %	25 %	212211671
37	NC_011527	ATC	2	6	2224	2229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211671
38	NC_011527	ATT	2	6	2242	2247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211671
39	NC_011527	GAG	2	6	2266	2271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212211671
40	NC_011527	AAT	2	6	2302	2307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211671
41	NC_011527	CTA	2	6	2321	2326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211671
42	NC_011527	AATT	2	8	2348	2355	50 %	50 %	0 %	0 %	212211671
43	NC_011527	GTG	2	6	2396	2401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211671
44	NC_011527	ATCG	2	8	2416	2423	25 %	25 %	25 %	25 %	212211671
45	NC_011527	ATT	2	6	2508	2513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211671
46	NC_011527	CCA	2	6	2525	2530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211671
47	NC_011527	AAG	2	6	2540	2545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211671
48	NC_011527	GAA	3	9	2551	2559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211671
49	NC_011527	AGC	2	6	2677	2682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211671
50	NC_011527	T	9	9	2834	2842	0 %	100 %	0 %	0 %	212211672
51	NC_011527	AATC	2	8	2877	2884	50 %	25 %	0 %	25 %	212211672
52	NC_011527	ATA	2	6	2943	2948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211672
53	NC_011527	TTA	2	6	2967	2972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211672
54	NC_011527	CA	3	6	2986	2991	50 %	0 %	0 %	50 %	212211672
55	NC_011527	CGAT	2	8	3028	3035	25 %	25 %	25 %	25 %	212211672
56	NC_011527	T	6	6	3124	3129	0 %	100 %	0 %	0 %	212211672
57	NC_011527	CCTT	2	8	3188	3195	0 %	50 %	0 %	50 %	212211672
58	NC_011527	T	7	7	3194	3200	0 %	100 %	0 %	0 %	212211672
59	NC_011527	TCA	2	6	3319	3324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211672
60	NC_011527	GTGG	2	8	3420	3427	0 %	25 %	75 %	0 %	212211672
61	NC_011527	AC	3	6	3492	3497	50 %	0 %	0 %	50 %	212211672
62	NC_011527	CAA	2	6	3572	3577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211672
63	NC_011527	TTAC	2	8	3585	3592	25 %	50 %	0 %	25 %	212211672
64	NC_011527	A	6	6	3627	3632	100 %	0 %	0 %	0 %	212211672
65	NC_011527	ATTT	2	8	3647	3654	25 %	75 %	0 %	0 %	212211672
66	NC_011527	CGA	2	6	3658	3663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211672
67	NC_011527	CCG	2	6	3669	3674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211672
68	NC_011527	TGAT	2	8	3702	3709	25 %	50 %	25 %	0 %	212211672
69	NC_011527	CGC	2	6	3814	3819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211672
70	NC_011527	TAGA	2	8	3919	3926	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011527	AGA	2	6	3961	3966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011527	AAT	2	6	4016	4021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011527	A	7	7	4032	4038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011527	A	7	7	4078	4084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011527	TGAGCG	2	12	4129	4140	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	212211673
76	NC_011527	CAC	2	6	4141	4146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211673
77	NC_011527	TTC	2	6	4157	4162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211673
78	NC_011527	CGA	2	6	4229	4234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211673
79	NC_011527	CAC	2	6	4248	4253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211673
80	NC_011527	CGA	2	6	4283	4288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211673
81	NC_011527	AGA	2	6	4391	4396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211673
82	NC_011527	GCC	2	6	4407	4412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211673
83	NC_011527	TTA	2	6	4417	4422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211673
84	NC_011527	CGG	2	6	4439	4444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211673
85	NC_011527	CGG	2	6	4475	4480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211673
86	NC_011527	GTG	2	6	4503	4508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211673
87	NC_011527	AGA	2	6	4520	4525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211673
88	NC_011527	GCTT	2	8	4715	4722	0 %	50 %	25 %	25 %	212211673
89	NC_011527	A	7	7	4830	4836	100 %	0 %	0 %	0 %	212211673
90	NC_011527	CATT	2	8	4841	4848	25 %	50 %	0 %	25 %	212211673
91	NC_011527	T	6	6	4933	4938	0 %	100 %	0 %	0 %	212211673
92	NC_011527	AAT	2	6	4947	4952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211673
93	NC_011527	CGG	2	6	4967	4972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211673
94	NC_011527	CACT	2	8	4973	4980	25 %	25 %	0 %	50 %	212211673
95	NC_011527	AGT	2	6	5096	5101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211673
96	NC_011527	CTTG	2	8	5216	5223	0 %	50 %	25 %	25 %	212211673
97	NC_011527	TGC	2	6	5267	5272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211673
98	NC_011527	ACG	2	6	5312	5317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211673
99	NC_011527	TGG	2	6	5401	5406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211673
100	NC_011527	TCT	2	6	5523	5528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211673
101	NC_011527	AGA	2	6	5576	5581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211673
102	NC_011527	ATC	2	6	5605	5610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211673
103	NC_011527	CCGACG	2	12	5626	5637	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	212211673
104	NC_011527	CA	3	6	5647	5652	50 %	0 %	0 %	50 %	212211673
105	NC_011527	TCT	2	6	5674	5679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211673
106	NC_011527	TA	3	6	5737	5742	50 %	50 %	0 %	0 %	212211673
107	NC_011527	A	7	7	5748	5754	100 %	0 %	0 %	0 %	212211673
108	NC_011527	GTT	2	6	5798	5803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211673
109	NC_011527	GCG	2	6	5886	5891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211673
110	NC_011527	TA	3	6	5946	5951	50 %	50 %	0 %	0 %	212211673
111	NC_011527	GCT	2	6	5960	5965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211673
112	NC_011527	TGAG	2	8	5995	6002	25 %	25 %	50 %	0 %	212211673
113	NC_011527	GGA	2	6	6035	6040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212211673
114	NC_011527	A	6	6	6093	6098	100 %	0 %	0 %	0 %	212211673
115	NC_011527	ATT	2	6	6135	6140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211673
116	NC_011527	TTG	2	6	6208	6213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211673
117	NC_011527	TA	3	6	6217	6222	50 %	50 %	0 %	0 %	212211673
118	NC_011527	A	6	6	6330	6335	100 %	0 %	0 %	0 %	212211673
119	NC_011527	TAT	2	6	6424	6429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211673
120	NC_011527	ACC	2	6	6471	6476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211673
121	NC_011527	CGC	2	6	6501	6506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211673
122	NC_011527	TCC	2	6	6558	6563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_011527	GCC	2	6	6669	6674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_011527	ACCC	2	8	6703	6710	25 %	0 %	0 %	75 %	212211674
125	NC_011527	A	7	7	6756	6762	100 %	0 %	0 %	0 %	212211674
126	NC_011527	TG	3	6	6826	6831	0 %	50 %	50 %	0 %	212211674
127	NC_011527	TGA	2	6	6836	6841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211674
128	NC_011527	GTAT	2	8	6884	6891	25 %	50 %	25 %	0 %	212211674
129	NC_011527	GTG	2	6	6921	6926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211674
130	NC_011527	GGA	2	6	6939	6944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212211674
131	NC_011527	GCA	2	6	7004	7009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211674
132	NC_011527	AAC	2	6	7117	7122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211674
133	NC_011527	GTT	2	6	7199	7204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211674
134	NC_011527	GTG	2	6	7231	7236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211674
135	NC_011527	AGCG	2	8	7271	7278	25 %	0 %	50 %	25 %	212211674
136	NC_011527	TTGT	2	8	7319	7326	0 %	75 %	25 %	0 %	212211674
137	NC_011527	TTG	2	6	7335	7340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211674
138	NC_011527	GAG	2	6	7368	7373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212211674
139	NC_011527	GGGT	2	8	7432	7439	0 %	25 %	75 %	0 %	212211674
140	NC_011527	TCA	2	6	7481	7486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211674
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143	NC_011527	TGT	2	6	7561	7566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211674
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145	NC_011527	GAAT	2	8	7699	7706	50 %	25 %	25 %	0 %	212211674
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147	NC_011527	CCG	2	6	7797	7802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211675
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149	NC_011527	AC	3	6	7832	7837	50 %	0 %	0 %	50 %	212211675
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153	NC_011527	CTTT	2	8	8017	8024	0 %	75 %	0 %	25 %	212211675
154	NC_011527	TCA	2	6	8025	8030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211675
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249	NC_011527	GGA	2	6	12265	12270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212211681
250	NC_011527	TAT	2	6	12285	12290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211681
251	NC_011527	TAA	2	6	12328	12333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211681
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256	NC_011527	A	8	8	12537	12544	100 %	0 %	0 %	0 %	212211681
257	NC_011527	TAA	2	6	12616	12621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211681
258	NC_011527	CAA	2	6	12638	12643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211681
259	NC_011527	ATCTC	2	10	12748	12757	20 %	40 %	0 %	40 %	212211681
260	NC_011527	TGA	2	6	12786	12791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211681
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262	NC_011527	CGC	2	6	12810	12815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211681
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264	NC_011527	A	7	7	12962	12968	100 %	0 %	0 %	0 %	212211681
265	NC_011527	A	6	6	13002	13007	100 %	0 %	0 %	0 %	212211681
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267	NC_011527	TAA	2	6	13126	13131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211682
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269	NC_011527	TTA	2	6	13202	13207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211682
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